每年的科研成果
每年的科研成果
个人简介
研究领域和方向
主要从事合成生物学、微生物组学、微生态学研究，以植物天然产物的微生物合成路径的理性设计、植物内生菌群落的数理模型构建与代谢互作机理研究为主要研究内容，利用生物反应系统的化学计量网络分析技术，预测微生物互作、人工途径与底盘细胞代谢网络的互作，然后结合组学技术与分子生物学技术，获得满足应用需求的工业微生物或微生物菌群。
教育背景
2005.09-2009.07 山东大学， 攻读微生物技术专业学士学位
2009.09-2013.04 美国明尼苏达大学，攻读生物系统工程专业博士学位 （导师：Roger R. Ruan）
2009.09-2013.04 美国明尼苏达大学，攻读生物系统工程专业博士学位 （导师：Roger R. Ruan）
工作履历
2013.07-2015.12 北京大学工学院 博士后（合作导师：吴晓磊）
2016.01-2019.02 北京大学工学院吴晓磊教授课题组 助理研究员
2019.03-今 北京理工大学化学与化工学院 预聘助理教授
2016.01-2019.02 北京大学工学院吴晓磊教授课题组 助理研究员
2019.03-今 北京理工大学化学与化工学院 预聘助理教授
研究成果
承担和组织的主要科研项目
1. XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX，军委科技委XX工程项目，XXX-XXX-XXX-XXX-XXX-XXX，负责人（200万元，2022.3-2023.12）
2. 细胞生长与异源生产全局动态偶联算法的开发与应用，国家自然科学基金面上项目，221708024，负责人（60万， 2022.1-2025.12）
3. 数字细胞建模与人工模拟，国家重点研发计划“合成生物学”重点专项，2020YFA0908300，研究骨干（60万， 2020.10-2025.10）
4. 内生菌群调节甘草合成三萜类化合物的作用机制及菌剂开发，中国科学院生化工程国家重点实验室开放基金课题，2020KF-05，负责人（15万， 2020.01-2022.12）
5. 产沼气过程互营脂肪酸降解微生物学及环境胁迫响应机制，政府间国际科技创新合作重点专项，2016YFE0127700，子课题负责人（44.64万，2017.01-2019.12）
6. 利用代谢网络模型构建协作微生物菌群以提高微生物石油污染治理效率，中国石油科技创新基金研究项目，2016D-5007-0701，负责人（18万，2016.10-2018.10）
7. 微生物协同利用石油烃作用的机理研究，国家自然基金青年科学基金项目，31400112，负责人（20万，2015.01-2016.12）
学术论文
1. Hu B#, Das P#, Lv X#, Shi M, Aa J, Wang K, Duan L, Gilbert JA, Nie Y, Wu X*. (2022) Effects of ‘healthy’ fecal microbiota transplantation against the deterioration of depression in Fawn-hooded rats. mSystems. 7(3): e0021822. (IF=7.328)
2. Hu B#, Zhao J#, Nie Y*, Qin X, Zhang K, Xing J, Wu X*. (2021) Bioemulsification and microbial community reconstruction in thermally processed crude oil. Microorganisms. 9(10): 2054. (IF=4.926)
3. 陈亚超，李楠楠，刘子迪，胡冰*，李春. (2021) 源于甘草内生菌的甘草酸合成相关功能基因的宏基因组挖掘. 中国生物工程杂志. 41(9): 37-47.
4. Zhao J#, Hu B#, Dolfing J, Li Y, Tang Y, Jiang Y, Chi C, Xing J, Nie Y*, Wu X*. (2021) Thermodynamically favorable reactions shape the archaeal community affecting bacterial community assembly in oil reservoirs. Sci Total Environ. 781: 146506. (IF=10.754)
5. Chen Y, Hu B*, Xing J, Li C*. (2021) Endophytes: the novel sources for plant terpenoid biosynthesis. Appl Microbiol Biotechnol. 105(11): 4501-4513. (IF=5.560)
6. Hu B, Wang M, Geng S, Wen L, Wu M, Nie Y, Tang Y, Wu X*. (2020) Metabolic exchange with alkane non-consumer Pseudomonas stutzeri SLG510A3-8 improves the n-alkane biodegradation of the alkane degrader Dietzia sp. DQ12-45-1b. Appl Environ Microbiol. 86(8): e02931-19. (IF=5.005)
7. Hu B, Nie Y, Geng S, Wu X*. (2015) Complete genome sequence of the petroleum-emulsifying bacterium Pseudomonas stutzeri SLG510A3-8. J Biotechnol. 211:1-2. (IF=3.595)
8. Hu B, Yang Q, Cai M, Tang Y, Zhao G, Wu X*. (2015) Negadavirga Shengliensis gen. nov., sp. nov., a novel member of the family Cyclobacteriaceae isolated from oil-contaminated saline soil. Antonie van Leeuw J Microb. 107: 663-73. (IF=2.158)
9. Hu B, Zhou W, Min M, Du Z, Chen P, Ma X, Liu Y, Lei H, Shi J, Ruan R*. (2013) Development of an effective acidogenically digested swine manure-based algal system for improved wastewater treatment and biofuel and feed production. Appl Energ. 107: 255-63. (IF=11.446)
10. Hu B, Min M, Zhou W, Du Z, Mohr M, Chen P, Zhu J, Cheng Y, Liu Y, Ruan R*. (2012) Enhanced mixotrophic growth of microalga Chlorella sp. on pretreated swine manure for simultaneous biofuel feedstock production and nutrient removal. Bioresour Technol. 126: 71-9. (IF=11.889)
11. Hu B, Min M, Zhou W, Li Y, Mohr M, Cheng Y, Lei H, Liu Y, Liu X, Chen P, Ruan R*. (2012) Influence of exogenous CO2 on biomass and lipid accumulation of microalgae Auxenochlorella protothecoides cultivated in concentrated municipal wastewater. Appl Biochem Biotechnol. 166: 1661-73. (IF=3.094)
专利
1. 吴晓磊；胡冰；聂勇；吴梦迪；一种利用特定微生物的代谢产物提高其他微生物的是由讲解能力的方法和产品，中国发明专利，2019-08-26，申请号：201910788970.5。
2. 胡冰；李春；刘子迪；李楠楠；一种基于生物信息学手段进行可促进乌拉尔甘草根部活性产物积累的内生菌理性筛选方法，中国发明专利，2022-01-10，申请号：202210020900.7。
获奖情况
2020年国际遗传工程机器大赛（iGEM）团队银奖
2020年度北京理工大学招生工作贡献奖
2021年度北京理工大学化学与化工学院年度考核优秀人员
2021年全国科普日优秀活动奖
1. XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX，军委科技委XX工程项目，XXX-XXX-XXX-XXX-XXX-XXX，负责人（200万元，2022.3-2023.12）
2. 细胞生长与异源生产全局动态偶联算法的开发与应用，国家自然科学基金面上项目，221708024，负责人（60万， 2022.1-2025.12）
3. 数字细胞建模与人工模拟，国家重点研发计划“合成生物学”重点专项，2020YFA0908300，研究骨干（60万， 2020.10-2025.10）
4. 内生菌群调节甘草合成三萜类化合物的作用机制及菌剂开发，中国科学院生化工程国家重点实验室开放基金课题，2020KF-05，负责人（15万， 2020.01-2022.12）
5. 产沼气过程互营脂肪酸降解微生物学及环境胁迫响应机制，政府间国际科技创新合作重点专项，2016YFE0127700，子课题负责人（44.64万，2017.01-2019.12）
6. 利用代谢网络模型构建协作微生物菌群以提高微生物石油污染治理效率，中国石油科技创新基金研究项目，2016D-5007-0701，负责人（18万，2016.10-2018.10）
7. 微生物协同利用石油烃作用的机理研究，国家自然基金青年科学基金项目，31400112，负责人（20万，2015.01-2016.12）
学术论文
1. Hu B#, Das P#, Lv X#, Shi M, Aa J, Wang K, Duan L, Gilbert JA, Nie Y, Wu X*. (2022) Effects of ‘healthy’ fecal microbiota transplantation against the deterioration of depression in Fawn-hooded rats. mSystems. 7(3): e0021822. (IF=7.328)
2. Hu B#, Zhao J#, Nie Y*, Qin X, Zhang K, Xing J, Wu X*. (2021) Bioemulsification and microbial community reconstruction in thermally processed crude oil. Microorganisms. 9(10): 2054. (IF=4.926)
3. 陈亚超，李楠楠，刘子迪，胡冰*，李春. (2021) 源于甘草内生菌的甘草酸合成相关功能基因的宏基因组挖掘. 中国生物工程杂志. 41(9): 37-47.
4. Zhao J#, Hu B#, Dolfing J, Li Y, Tang Y, Jiang Y, Chi C, Xing J, Nie Y*, Wu X*. (2021) Thermodynamically favorable reactions shape the archaeal community affecting bacterial community assembly in oil reservoirs. Sci Total Environ. 781: 146506. (IF=10.754)
5. Chen Y, Hu B*, Xing J, Li C*. (2021) Endophytes: the novel sources for plant terpenoid biosynthesis. Appl Microbiol Biotechnol. 105(11): 4501-4513. (IF=5.560)
6. Hu B, Wang M, Geng S, Wen L, Wu M, Nie Y, Tang Y, Wu X*. (2020) Metabolic exchange with alkane non-consumer Pseudomonas stutzeri SLG510A3-8 improves the n-alkane biodegradation of the alkane degrader Dietzia sp. DQ12-45-1b. Appl Environ Microbiol. 86(8): e02931-19. (IF=5.005)
7. Hu B, Nie Y, Geng S, Wu X*. (2015) Complete genome sequence of the petroleum-emulsifying bacterium Pseudomonas stutzeri SLG510A3-8. J Biotechnol. 211:1-2. (IF=3.595)
8. Hu B, Yang Q, Cai M, Tang Y, Zhao G, Wu X*. (2015) Negadavirga Shengliensis gen. nov., sp. nov., a novel member of the family Cyclobacteriaceae isolated from oil-contaminated saline soil. Antonie van Leeuw J Microb. 107: 663-73. (IF=2.158)
9. Hu B, Zhou W, Min M, Du Z, Chen P, Ma X, Liu Y, Lei H, Shi J, Ruan R*. (2013) Development of an effective acidogenically digested swine manure-based algal system for improved wastewater treatment and biofuel and feed production. Appl Energ. 107: 255-63. (IF=11.446)
10. Hu B, Min M, Zhou W, Du Z, Mohr M, Chen P, Zhu J, Cheng Y, Liu Y, Ruan R*. (2012) Enhanced mixotrophic growth of microalga Chlorella sp. on pretreated swine manure for simultaneous biofuel feedstock production and nutrient removal. Bioresour Technol. 126: 71-9. (IF=11.889)
11. Hu B, Min M, Zhou W, Li Y, Mohr M, Cheng Y, Lei H, Liu Y, Liu X, Chen P, Ruan R*. (2012) Influence of exogenous CO2 on biomass and lipid accumulation of microalgae Auxenochlorella protothecoides cultivated in concentrated municipal wastewater. Appl Biochem Biotechnol. 166: 1661-73. (IF=3.094)
专利
1. 吴晓磊；胡冰；聂勇；吴梦迪；一种利用特定微生物的代谢产物提高其他微生物的是由讲解能力的方法和产品，中国发明专利，2019-08-26，申请号：201910788970.5。
2. 胡冰；李春；刘子迪；李楠楠；一种基于生物信息学手段进行可促进乌拉尔甘草根部活性产物积累的内生菌理性筛选方法，中国发明专利，2022-01-10，申请号：202210020900.7。
获奖情况
2020年国际遗传工程机器大赛（iGEM）团队银奖
2020年度北京理工大学招生工作贡献奖
2021年度北京理工大学化学与化工学院年度考核优秀人员
2021年全国科普日优秀活动奖
与联合国可持续发展目标相关的专业知识
2015 年，联合国成员国同意 17 项可持续发展目标 (SDG)，以消除贫困、保护地球并确保全人类的繁荣。此人的工作有助于实现下列可持续发展目标：
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最近五年的合作关系和顶尖研究领域
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Corrigendum to “Self-controlled in silico gene knockdown strategies to enhance the sustainable production of heterologous terpenoid by Saccharomyces cerevisiae” [Metab. Eng. 83 (2024) 172–182, (S1096717624000594), (10.1016/j.ymben.2024.04.005)]
Zhang, N., Li, X., Zhou, Q., Zhang, Y., Lv, B., Hu, B. & Li, C., 5月 2024, 在: Metabolic Engineering. 83, 页码 217 1 页码科研成果: 期刊稿件 › 评论/辩论
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Self-controlled in silico gene knockdown strategies to enhance the sustainable production of heterologous terpenoid by Saccharomyces cerevisiae
Zhang, N., Li, X., Zhou, Q., Zhang, Y., Lv, B., Hu, B. & Li, C., 5月 2024, 在: Metabolic Engineering. 83, 页码 172-182 11 页码科研成果: 期刊稿件 › 文章 › 同行评审
2 引用 （Scopus） -
Abiotic factors and endophytes co-regulate flavone and terpenoid glycoside metabolism in Glycyrrhiza uralensis
Liu, Z., Ma, Y., Lv, X., Li, N., Li, X., Xing, J., Li, C. & Hu, B., 4月 2023, 在: Applied Microbiology and Biotechnology. 107, 7-8, 页码 2671-2688 18 页码科研成果: 期刊稿件 › 文章 › 同行评审
开放访问3 引用 （Scopus） -
Improvement of Oleanolic Acid Production in Saccharomyces Cerevisiae Based on OptKnock Framework
Li, X. & Hu, B., 23 11月 2023, Advances in Biomedical and Bioinformatics Engineering - Proceedings of the 3rd International Conference on Biomedicine and Bioinformatics Engineering, ICBBE 2023. Yu, Y., Nguyen, B. P. & Sang, J. (编辑). IOS Press BV, 页码 111-122 12 页码 (Studies in Health Technology and Informatics; 卷 308).科研成果: 书/报告/会议事项章节 › 会议稿件 › 同行评审
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Effects of ‘Healthy’ Fecal Microbiota Transplantation against the Deterioration of Depression in Fawn-Hooded Rats
Hu, B., Das, P., Lv, X., Shi, M., Aa, J., Wang, K., Duan, L., Gilbert, J. A., Nie, Y. & Wu, X. L., 6月 2022, 在: mSystems. 7, 3科研成果: 期刊稿件 › 文章 › 同行评审
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